一、雕刻

玉皇殿廟宇建築採用大量的雕刻作品作為裝飾構件，其中包含了石雕和木雕兩種，依雕刻的方法，可粗分為三大類，第一類為圓雕，又稱為六面雕或立體雕，它的特徵是將題材完整的雕刻出來，呈現其造型的立體化，如同廟宇前的石獅和龍柱。第二類為透雕，又稱為內枝外葉或漏雕，最大的特點就是雕刻出的作品有許多漏空的地方，具有窗戶可供採光的功能，在廟宇大門旁的身堵部位，常可見到這種雕刻工法的作品。第三類為浮雕，是一種不漏空的單面雕刻作品，又可細分為陽刻及陰刻。陽刻就是把所要雕刻的圖案以外的部份剔除，依照其剔除的程度又可分為深浮雕與淺浮雕，深浮雕是將圖案以外的部份，深深剔除，讓圖案明顯地凸出於表面；而淺浮雕則是將所要雕刻的圖案以外的部份，淺淺地剔去一層，讓圖案隱隱浮現出來。至於陰刻，則是在磨平的石材上，將所要雕刻的圖案剔去凹陷於石材表面，表現出明顯的線條。

因為玉皇殿經歷了多次修建工程，最後採用了鋼筋水泥結構，原本木結構的部分多由新工法所取代，因此玉皇殿內的木雕作品，多集中於神龕的裝飾構件，而石雕作品則相對繁複，除了正立面顯目可見的龍柱和石獅之外，各壁堵上亦多置石雕作品，其雕刻的題材十分廣泛，從歷史章回小說三國志的賜袍贈金、三英戰呂布等故事，到吉祥圖案如九龍圖、天官賜福、招財進寶、祈求吉慶、三王圖、年年有餘，以及龍、鳳、麒麟、獅、四獸等靈獸，造型與題材十分豐富而多樣，而最具特色的，則是採用梧棲書畫名家黃海泉提供的歷代名人如朱熹、鄭板橋、曾國藩、李鴻章、左宗棠、沈葆真、康有為、梁啟超、胡漢民……等人的墨寶，雕刻成壁堵作品，這些作品在原本繁複的裝飾作品中，突顯了清新的風格，讓玉皇殿充滿了特有的書卷氣質。

二、交趾陶

交趾陶或稱為交趾燒，早期常利用野地搭建臨時窯燒製，是一種低溫(低於攝氏800度)燒製的陶藝，顏色鮮麗生動，製作的程序繁雜，因為是低溫燒製，所以質地較為疏鬆，並不利於長期保存，多做成人物、走獸及博古靜物等，常見裝飾於廟宇建築的屋脊、水車堵、身堵、墀頭等處。不過近代因為瓦斯窯與電窯的發展，交趾陶的燒製技術大幅改進，早期作品不耐久的特色已獲得改善。

玉皇殿的交趾陶作品主要分佈於三川殿及正殿的屋脊及牌頭之上，其題材有天官賜福……等，另外在各個屋頂牌頭上亦有眾多歷史故事題材的交趾陶人物，其造型栩栩如生，作工精緻，色彩艷麗，是值得細細品味的作品。

三、剪黏

剪黏最早流行於中國南方的漳州、泉州及潮州一帶，大約至一百五、六十年前才引進臺灣，因為作品精美瑰麗，在臺灣的廟宇建築中，很快地成為最常見的裝飾工法。從字面的意義看來，剪黏須有二個動作，一為剪，二為黏，也就是先剪後黏，以鑲嵌的手法來營造浮雕的效果。

剪黏最初的發展只是交趾陶的替代品，因為交趾陶造價昂貴，而泥塑不耐久用，因而有剪黏工法的產生，早期剪黏的材料是利用破掉的瓷碗片，最先要以鐵絲捆紮骨架，並用灰泥塑成基體，在基體尚未完全乾燥凝固之期間，修剪破陶、瓷碗片鑲嶔於基體之上，利用破瓷碗片的弧度和其中的色彩，來表現人物的神韻，或動、植物的形態，因此作品稱之為剪黏。

在日治時期以後，因彩色玻璃及塑膠片等新材料的出現，匠師逐漸以彩色玻璃及塑膠片取代了原有的破陶、瓷碗片，因此，剪黏的作品更趨於繁瑣而多彩，最常見的裝飾地點即為水車堵、屋脊及牌頭上的各種動、植物與人物，因為剪黏作品多變而且色彩絢麗亮眼，自然成為廟宇裝飾不可或缺的工藝品。但是因為剪黏所施作的地點多在廟宇建築的高處，所以常常被人們所忽略或視而不見。

近年來，因為工業快速發展，為因應工商時代講求工作效率的潮流，剪黏的製作也突破傳統的工法，現在的剪黏多是由工廠燒製成組的陶片零組件，施工時，省略原本剪陶、瓷片或玻璃片的步驟，直接將燒製好的陶片組裝於廟宇建築之上，這樣的作品雖然施工快速，但也失去了傳統匠師所賦予作品的生命力。

在玉皇殿的屋頂上可見到許多龍、鳳造型的裝飾採用剪黏的作品，其華麗的造型及艷麗的色彩，為玉皇殿增添了美觀與氣勢，如果仔細觀察，玉皇殿的剪黏作品栩栩如生，是十分精緻的作品。

四、彩繪

彩繪最初的目的是為保護木、土結構，在其表面施以他種材質，並結合各種色彩，不僅期望能增加其使用年限，更達到美化建築的功能。彩繪在傳統寺廟的使用，不僅要考量實用、延長建材使用年限，以及美觀等用途，更進一步結合了傳統陰陽、五行的觀念，甚至展現禮教和封建階級的體制。

廟宇建築中的彩繪除了門神之外，主要可分為二大類，一類為樑柱彩繪，另一類則為壁堵彩繪。閩南方言說「紅宮黑祖厝」，其中宮指的就是廟宇，而祖厝則是指家族祠堂，由此可知臺灣廟宇的樑柱彩繪以朱色為底色，並在正脊上彩繪太極八卦，樑枋上則以花鳥、走獸、山水、人物或書法等為題材，而壁堵上的彩繪則因面積較大，可以讓彩繪師傅盡情發揮，所以常見到歷史章回小說或民間傳說故事。

玉皇殿的彩繪作品數量頗多，除了門神之外，在樑枋上的彩繪亦十分精彩，中央正門門神繪以康元帥及趙元帥，兩側分別為宮監及宮女。而樑枋上的彩繪題材則廣泛地應用歷史章回小說或民間戲曲的故事，有三國演義中的臥牛山收周倉；忠、孝、節、義(岳飛精忠報國、花木蘭代父從軍、蘇武北海守節、關雲長正氣參天)；四不足等的題材，另外在三川殿的藻井有八仙彩繪，正殿內則有風神、雷神的彩繪，這些作品頗具藝術價值。